يعتبر أبو إسحق الزرقالي من العلماء المسلمين البارزين في علم الفلك. فقد ترك بصمات واضحة في الدراسات الفلكية على مستوى العالم. وقد سُميت إحدى الفوهات القمرية باسمه اعترافا بإسهاماته في علم الفلك. يعرف عنه أنه اخترع ساعة مائية، وأدخل تحسينات في الإسطرلاب وصحح بيانات جغرافية لدى بطليموس والخوارزمي. وقد أشاد كوبرنيكوس بالزرقالي واقتبس من آرائه لبيان نظريته بشأن النظام الشمسي. وكان يعتبر الزرقالي من أعلام علم الأعداد في زمانه.